Con l'entrata in guerra dell'Italia nel 1940, l'industria lavorava per le richieste che comportavano le esigenze della guerra. La manodopera per lo sforzo bellico era fornita dalla scuola tecnica professionale attraverso i corsi diurni e serali; oltre ai tecnici professionali erano richiesti molti tecnici nel reparto officina ed esperti di laboratorio che solo l'istituto tecnico industriale poteva fornire. Le industrie folignati richiedevano sempre tecnici dai pochi istituti industriali esistenti nella zona. La condizione economica e l'area geografica della città erano soddisfacenti per creare ad un istituto per soddisfare le esigenze locali.
L'azione di Giorgio Guarrella e di Pietro Mazzereni fece sì che, con un decreto ministeriale nel 1940 e con un contributo statale di 500.000 lire nell'anno scolastico 1940-41, partisse il corso d'istruzione per le prime due classi dell'istituto tecnico industriale di Foligno per periti industriali elettricisti; tale corso fu il primo di questo genere in provincia di Perugia. Nel suo primo anno di vita l'istituto contava 83 iscritti nelle prime due classi.Vi era però il problema di dover ospitare sia gli alunni della scuola professionale sia gli alunni dell'istituto tecnico industriale nel vecchio convento. Il comune di Foligno per risolvere questo problema costruì un primo lotto di quattro aule e un grosso padiglione. Contemporaneamente si costruiva un altro edificio scolastico con locali interrati utilizzato come rifugio anti-aereo per la guerra. Nonostante la guerra al nuovo istituto, nei primi tre anni, non mancarono i finanziamenti che lo misero in condizione di poter disporre d'attrezzature e macchinari. Nel 1943 ci furono i primi periti industriali e per quanto riguarda la guerra la situazione si aggravò notevolmente e così per l'istituto industriale e annessa scuola tecnica e d'avviamento cominciarono le prime difficoltà. Nel luglio del 1943 fu firmata una cambiale per pagare gli stipendi del personale della scuola; con i bombardamenti del settembre del 1943 tutti gli uffici centrali vennero trasferiti nel nord dell'Italia, poiché l'Umbria era sotto il dominio tedesco.
Il personale della scuola si rifugiò nelle campagne e nelle frazioni, poiché la città di Foligno era sotto pesanti bombardamenti che rendevano impraticabili i servizi pubblici. La scuola continuò a funzionare e per molti giorni i trasferimenti dei materiali avvennero sotto il controllo dei tedeschi. Gli stipendi dei professori furono pagati regolarmente e gli esami dell'anno 1943-44 iniziarono il 20 maggio e si svolsero all'aperto in un casolare. Quando gli inglesi arrivarono a Foligno, nel giugno 1944, trovarono la città semidistrutta poichè, nel periodo appena prima dell'arrivo degli inglesi, Foligno era stata bersaglio di molti bombardamenti: 36 bombardamenti in sei mesi. Nel frattempo la scuola fu occupata dalle truppe indiane e africane che gli arrecarono ulteriori danni oltre quelli dei bombardamenti.Le macchine utensili più moderne furono prese dalle officine Grandi Riparazioni Ferrovie dello Stato. Il preside Guarella fece aprire le iscrizioni per l'anno scolastico 1944-45, gli iscritti furono ben 559. Le lezioni teoriche si tenevano in una soffitta di un orfanotrofio femminile, privo di riscaldamento, ma nonostante tutto ciò si diplomarono ben 58 periti. Durante quest'anno scolastico la scuola ebbe ancora problemi finanziari, emise così una nuova cambiale per i pagamenti da fare finchè non arrivarono i fondi del governo militare alleato. Il 18 ottobre 1945 furono restituiti dalle autorità i soldi precedentemente anticipati e subito il Comune fece una perizia sui lavori da fare e avviò la pratica. Prima che tale pratica potesse completare il suo percorso di approvazioni sarebbe trascorso troppo tempo e perciò il Preside e il Presidente del Consiglio d'Amministrazione fecero subito eseguire i lavori di ristrutturazione: si poterono così cominciare regolarmente le lezioni grazie anche all'aiuto del genio civile.Nello stesso anno il preside Guarella si trasferì in una sede universitaria, lasciando alla città di Foligno una scuola perfettamente funzionante.
